協(xié)同創(chuàng)新中心實行理事會指導下的主任負責制，理事會作為協(xié)同創(chuàng)新中心的決策機構(gòu)，由高等學校、科研院所、行業(yè)主管部門、需求方等各單位的代表共同組成，協(xié)同負責創(chuàng)新中心重大工作事項決策。理事會設(shè)理事長1名，副理事長4名、理事15名，秘書長1名。其中理事長、副理事長采用推選制，由中心成員法定代表人或主要領(lǐng)導擔任。